Следует принимать во внимание болезни рыболовства, поскольку некоторые болезни могут передаваться человеку при употреблении в пищу, а некоторые могут быстро привести к летальному исходу. Это нарушает здоровье водной среды. Распространенными видами болезней рыб являются микобактериоз и нокардиоз, нематоды Anisakis, болезнь раков («тюлений палец»).