Архив клинической микробиологии

Рекомендации для авторов

Чтобы подать новую рукопись, авторы должны использовать систему онлайн-подачи.

Политика

ИТ-медицинская команда் Журналы публикуют оригинальные исследовательские статьи, имеющие выдающееся медицинское значение. Мы рассмотрим рукописи любого объема; мы поощряем подачу как существенных полноформатных работ, так и более коротких рукописей, в которых сообщаются новые результаты, которые могут быть основаны на более ограниченном диапазоне экспериментов.

Архив клинической микробиологии — рецензируемый журнал, который принимает научные статьи, обзорные статьи, тематические исследования и краткие сообщения в области микробиологии и инфекционных заболеваний.

Система онлайн-подачи

Стиль письма должен быть кратким и доступным, избегая жаргона, чтобы статья была понятна читателям, не имеющим специализации, или тем, чей родной язык не английский. Редакторы будут предлагать, как этого добиться, а также предлагать сокращения или дополнения, которые можно внести в статью, чтобы усилить аргументацию. Наша цель — сделать редакционный процесс строгим и последовательным, но не навязчивым или властным. Авторам предлагается высказывать свое мнение и решать, как лучше всего представить свои идеи, результаты и выводы. Хотя мы поощряем подачу заявок со всего мира, мы требуем, чтобы рукописи были представлены на английском языке. Авторы, для которых английский не является родным языком, могут связаться с нами для получения дополнительной информации. В качестве шага к преодолению языкового барьера при принятии статьи, мы призываем авторов, свободно владеющих другими языками, предоставлять копии своих полных статей или тезисов на других языках. Мы опубликуем эти переводы в качестве вспомогательной информации и перечислим их вместе с другими файлами вспомогательной информации в конце текста статьи.

Плата за обработку статей (APC):

Публикация в открытом доступе не обходится без затрат. ИТ-медицинская команда் Журналы покрывают эти расходы за счет сборов за обработку статей (APC), которые выплачиваются авторами после того, как рукопись принята к публикации. ИТ-медицинская команда் не взимает плату за подписку на свой исследовательский контент, вместо этого полагая, что немедленный, всемирный, безбарьерный, открытый доступ к полному тексту исследовательских статей отвечает интересам научного сообщества.  

Среднее время обработки статьи (APT) — 55 дней.

Базовая плата за обработку статьи или стоимость обработки рукописи соответствует цене, указанной выше, с другой стороны, она может варьироваться в зависимости от обширного редактирования, цветовых эффектов, сложных уравнений, дополнительного удлинения номера. страниц статьи и т.д.

Тип рукописи Стоимость обработки статьи (в долларах США) Стоимость обработки статьи (в евро) Стоимость обработки статьи (в фунтах стерлингов) Все типы статей 1357 1219 1036 Специальная статья 1357 1219 1036

Быстрый процесс редакционного оформления и рецензирования  (процесс рецензирования FEE):

Архив клинической микробиологии участвует в ускоренном редакционном процессе оформления и рецензирования (FEE-Review Process) с дополнительной предоплатой в размере 99 долларов США помимо обычного сбора за обработку статьи. Fast Editorial Execution and Review Process — это специальная услуга для статьи, позволяющая получить более быстрый ответ на этапе предварительного рецензирования от обрабатывающего редактора, а также рецензию от рецензента. Автор может получить более быстрый ответ: максимум до предварительного рецензирования в течение 3 дней с момента подачи и процесс рецензирования рецензентом максимум в течение 5 дней с последующей доработкой/публикацией в течение 2 дней. Если статья получит уведомление о доработке от ответственного редактора, то потребуется еще 5 дней для внешнего рецензирования предыдущим рецензентом или альтернативным рецензентом.

Принятие рукописей полностью зависит от рассмотрения редакционной группы и независимого рецензирования, обеспечивая соблюдение самых высоких стандартов независимо от пути к регулярной рецензируемой публикации или быстрому процессу редакционного рецензирования. Ответственный редактор и автор статьи несут ответственность за соблюдение научных стандартов. Плата за рассмотрение статьи в размере 99 долларов США не будет возвращена, даже если статья будет отклонена или отозвана для публикации.

The corresponding author or institution/organization is responsible for making the manuscript FEE-Review Process payment. The additional FEE-Review Process payment covers the fast review processing and quick editorial decisions, and regular article publication covers the preparation in various formats for online publication, securing full-text inclusion in a number of permanent archives like HTML, XML, and PDF, and feeding to different indexing agencies.

Authors Withdrawal Policy

Время от времени автор может пожелать отозвать рукопись после подачи. Изменение своего мнения является прерогативой автора, и автор имеет право бесплатно отозвать статью при условии, что статья будет отозвана до принятия. После принятия статьи начинается обработка. При этом в случае отзыва статьи после ее принятия со статьи взимается обязательная сумма постобработки.

Организация рукописи

Большинство статей, публикуемых в журналах ИТ-медицинская команда், будут организованы по следующим разделам: название, авторы, организации, аннотация, введение, методы, результаты, обсуждение, ссылки, благодарности и легенды к рисункам. Единообразие формата поможет читателям и пользователям журнала. Однако мы понимаем, что этот формат не идеален для всех типов исследований. Если у вас есть рукопись, для которой было бы полезно использовать другой формат, свяжитесь с редакторами для дальнейшего обсуждения этого вопроса. Хотя у нас нет жестких ограничений по объему всей рукописи или отдельных разделов, мы призываем авторов кратко представлять и обсуждать свои выводы.

Название (максимум 125 символов)

Название должно быть конкретным для исследования, но при этом кратким и должно позволять деликатный и конкретный поиск статьи в электронном виде. Оно должно быть понятно читателям за пределами вашей области. По возможности избегайте специальных сокращений. Заголовки должны быть представлены в заглавном регистре, то есть все слова, кроме предлогов, артиклей и союзов, должны быть написаны с заглавной буквы. Если статья представляет собой рандомизированное контролируемое исследование или метаанализ, это описание должно быть в названии.

Примеры:

Изменение климата и рост распространения малярии в странах Африки к югу от Сахары. Кластерное рандомизированное контролируемое исследование вмешательства под руководством медсестры

Авторы и филиалы

Укажите имена или инициалы (если используются), отчества или инициалы (если используются), фамилии и сведения о филиалах (отдел, университет или организация, город, штат/провинция (если применимо) и страну) для всех авторов. Один из авторов должен быть назначен автором-переписчиком. Соответствующий автор несет ответственность за то, чтобы список авторов и краткое изложение вклада авторов в исследование были точными и полными. Если статья была представлена ​​от имени консорциума, все члены консорциума и филиалы должны быть перечислены после выражения «Благодарности».

(Критерии авторства см. в разделе «Подтверждающая информация и материалы, необходимые при подаче»).

Абстрактный

Аннотация разделена на следующие четыре раздела со следующими заголовками: Название, Предыстория, Методы и результаты и Выводы. Он должен содержать все следующие элементы, за исключением пунктов в квадратных скобках, которые необходимы только для некоторых типов исследований. Пожалуйста, используйте тот же формат для тезисов, представленных в качестве предварительных запросов.

Заголовок

Это должно быть четкое описание содержания статьи. Дизайн должен присутствовать в рандомизированных контролируемых исследованиях, систематических обзорах или метаанализах и должен быть включен в другие типы исследований, если это полезно.

Фон

В этом разделе должно быть четко описано обоснование проводимого исследования. Оно должно заканчиваться изложением конкретной гипотезы исследования и/или целей исследования.

Методы и результаты

Опишите участников или то, что изучалось (например, клеточные линии, группы пациентов; будьте как можно более конкретными, включая количество изученных). Опишите дизайн исследования/вмешательство/основные использованные методы/Что оценивалось в первую очередь, например, первичный результат и, если применимо, в течение какого периода.

[При необходимости укажите, сколько участников из числа зачисленных прошли оценку, например, какова была доля ответивших на опрос.]

[Если это важно для понимания статьи, опишите, как были проанализированы результаты, т.е. какие конкретные статистические тесты использовались.]

Для основных результатов при необходимости укажите численный результат (это почти всегда так) и меру его точности (например, 95% доверительный интервал). Опишите любые нежелательные явления или побочные эффекты.

Опишите основные ограничения исследования.

Выводы

Предоставьте общую интерпретацию результатов с важными рекомендациями для будущих исследований.

[Для клинического исследования укажите любые идентификационные номера и названия исследования (например, регистрационный номер исследования, номер протокола или аббревиатуру).]

Введение

Во введении должна обсуждаться цель исследования в более широком контексте. Составляя введение, подумайте о читателях, которые не являются экспертами в этой области. Включите краткий обзор ключевой литературы. Если в этой области существуют соответствующие разногласия или разногласия, о них следует упомянуть, чтобы читатель, не являющийся экспертом, мог глубже вникнуть в эти вопросы. Введение должно завершаться кратким изложением общей цели экспериментов и комментарием о том, была ли эта цель достигнута.

Методы

Этот раздел должен содержать достаточно подробностей для воспроизведения результатов. Должны быть включены протоколы для новых методов, но можно просто сослаться на хорошо зарекомендовавшие себя протоколы. Подробную методологию или вспомогательную информацию, относящуюся к методологии, можно опубликовать на нашем веб-сайте.

Этот раздел также должен включать раздел с описанием любых использованных статистических методов. Они должны соответствовать критериям, изложенным в Единых требованиях, следующим образом: «Опишите статистические методы достаточно подробно, чтобы дать возможность знающему читателю, имеющему доступ к исходным данным, проверить сообщаемые результаты. Когда это возможно, дайте количественную оценку результатам и представьте их с соответствующими индикаторами. ошибок измерения или неопределенности (например, доверительные интервалы). Избегайте полагаться исключительно на проверку статистических гипотез, например, на использование значений P, которые не могут передать важную количественную информацию. Обсудите приемлемость участников исследования. Дайте подробную информацию о рандомизации. Опишите методы и успех любого сокрытия наблюдений Сообщите об осложнениях лечения Укажите количество наблюдений. Сообщайте о потерях для наблюдения (например, о выбывании из клинического исследования). Ссылки на дизайн исследования и статистические методы должны, если это возможно, быть на стандартные работы (с указанием страниц), а не на статьи, в которых первоначально сообщалось о дизайне или методах. Укажите любые используемые компьютерные программы общего пользования».

Полученные результаты

Раздел результатов должен включать все соответствующие положительные и отрицательные результаты. Раздел может быть разделен на подразделы, каждый из которых имеет краткий подзаголовок. Большие наборы данных, включая необработанные данные, следует предоставлять в качестве вспомогательных файлов; они публикуются в Интернете вместе с принятой статьей. Раздел результатов должен быть написан в прошедшем времени.

Как указано в Единых требованиях, авторы, представляющие статистические данные в разделе «Результаты», должны «... указать статистические методы, используемые для их анализа. Ограничить таблицы и рисунки теми, которые необходимы для объяснения аргументации статьи и оценки ее поддержки. . Используйте графики в качестве альтернативы таблицам с большим количеством записей; не дублируйте данные в графиках и таблицах. Избегайте нетехнического использования технических терминов в статистике, таких как «случайный» (что подразумевает устройство рандомизации), «нормальный», «значительный», «значительный», «значительный». «Корреляции» и «выборка». Дайте определение статистическим терминам, сокращениям и большинству символов.

Обсуждение

Обсуждение должно быть кратким и аргументированным. Его следует начать с краткого изложения основных выводов. Он должен включать параграфы, посвященные обобщаемости, клинической значимости, сильным сторонам и, что наиболее важно, ограничениям вашего исследования. Вы также можете обсудить следующие моменты. Как выводы влияют на существующие знания в этой области? Как будущие исследования могут опираться на эти наблюдения? Какие ключевые эксперименты необходимо провести?

Рекомендации

В список литературы следует включать только опубликованные или принятые рукописи. Не следует цитировать встречи, тезисы, доклады на конференциях или статьи, которые были представлены, но еще не приняты. Ограниченное цитирование неопубликованных работ должно быть включено только в текст. Все личные сообщения должны быть подкреплены письмом от соответствующих авторов.

ИТ-медицинская команда использует метод нумерованного цитирования (цитирования-последовательности). Ссылки перечисляются и нумеруются в порядке их появления в тексте. В тексте ссылки должны обозначаться номером ссылки в скобках. Множественные цитаты в одних скобках следует разделять запятыми. Если имеется три или более последовательных цитат, их следует указывать в виде диапазона. Пример: «...было показано ранее [1,4–6,22]». Прежде чем заказывать цитирование, убедитесь, что части рукописи расположены в правильном порядке для соответствующего журнала. Подписи к рисункам и таблицам должны располагаться в конце рукописи.

Поскольку ссылки будут в максимально возможной степени связаны с цитируемыми ими статьями в электронном виде, правильное форматирование ссылок имеет решающее значение. Пожалуйста, используйте следующий стиль для списка ссылок:

Опубликованные статьи

1. Сэнгер Ф., Никлен С., Коулсон А.Р. (1977) Секвенирование ДНК с использованием ингибиторов обрыва цепи. Proc Natl Acad Sci USA 74: 5463–5467.

Пожалуйста, перечислите первых пяти авторов, а затем добавьте «и др.». если есть дополнительные авторы. Использование номера DOI в полнотекстовой статье допускается в качестве альтернативы традиционным номерам томов и страниц или в дополнение к ним.

Принятые статьи

То же, что и выше, но вместо номеров страниц отображается «В печати». Пример: Путь Adv Clin. В прессе.

Статьи электронного журнала

1. Локер В.М. (1996) «Кемпесинос» и кризис модернизации в Латинской Америке. Jour Pol Ecol 3. По состоянию на 11 августа 2006 г.

Книги

1. Бейтс Б. (1992) Торг на всю жизнь: социальная история туберкулеза. Филадельфия: Издательство Пенсильванского университета. 435 стр.

Главы книг

1. Хансен Б. (1991)Эпидемии и история Нью-Йорка для общественности. В: Харден В.А., Риссе ГБ, редакторы. СПИД и историк. Бетесда: Национальные институты здравоохранения. стр. 21–28.

Благодарности

Люди, внесшие вклад в работу, но не соответствующие критериям авторов, должны быть перечислены в Благодарностях вместе с их вкладом. Вы также должны убедиться, что все, кто упомянут в благодарностях, согласны на то, чтобы их называли так.

Подробная информация об источниках финансирования, поддержавших работу, должна быть ограничена заявлением о финансировании. Не включайте их в Благодарности.

Финансирование

В этом разделе должны быть описаны источники финансирования, которые поддержали работу. Пожалуйста, также опишите роль спонсора(ов) исследования, если таковой имеется, в планировании исследования; сбор, анализ и интерпретация данных; написание статьи; и решение представить его для публикации.

Конкурирующие интересы

В этом разделе должны быть перечислены конкретные конкурирующие интересы, связанные с любым из авторов. Если авторы заявляют об отсутствии конкурирующих интересов, мы напечатаем соответствующее заявление.

Сокращения

Пожалуйста, сведите сокращения к минимуму. Перечислите все нестандартные сокращения в алфавитном порядке вместе с их развернутой формой. Определите их также при первом использовании в тексте. Недопустимо использовать нестандартные сокращения, если они не встречаются в тексте не менее трех раз.

Номенклатура

Использование стандартизированной номенклатуры во всех областях науки и медицины является важным шагом на пути к интеграции и связыванию научной информации, представленной в опубликованной литературе. Мы будем обеспечивать использование правильной и устоявшейся номенклатуры везде, где это возможно:

Мы настоятельно рекомендуем использовать единицы СИ. Если вы не используете их исключительно, укажите значение SI в скобках после каждого значения.

Названия видов должны быть выделены курсивом (например, Homo sapiens), а род и вид должны быть записаны полностью как в названии рукописи, так и при первом упоминании организма в статье; после этого можно использовать первую букву названия рода, за которой следует полное название вида.

Гены, мутации, генотипы и аллели следует указывать курсивом. Используйте рекомендованное имя, обратившись к соответствующей базе данных генетической номенклатуры, например, HUGO для генов человека. Иногда целесообразно указывать синонимы гена при первом его появлении в тексте. Префиксы генов, например те, которые используются для онкогенов или клеточной локализации, должны быть указаны прямым шрифтом: v-fes, c-MYC и т. д.

Необходимо указать рекомендуемое международное непатентованное наименование (рМНН) лекарств.

Инвентарные номера

Все соответствующие наборы данных, изображения и информация должны быть размещены в общедоступных ресурсах. Укажите соответствующие инвентарные номера (и номера версий, если применимо). Номера доступа должны быть указаны в скобках после названия объекта при первом использовании. Предлагаемые базы данных включают, помимо прочего:

МассивЭкспресс

База данных биомоделей

База данных взаимодействующих белков

Банк данных ДНК Японии [DDBJ]

База данных нуклеотидных последовательностей EMBL

ГенБанк

Омнибус экспрессии генов [GEO]

Банк данных по белкам

UniProtKB/Swiss-Prot

ClinicalTrials.gov

Кроме того, насколько это возможно, предоставьте инвентарные номера или идентификаторы для всех объектов, таких как гены, белки, мутанты, заболевания и т. д., о которых есть запись в общедоступной базе данных, например:

Ансамбль

Энтрез Джин

FlyBase

ИнтерПро

База данных геномов мышей (MGD)

Онлайн-менделевское наследование у человека (OMIM)

Предоставление инвентарных номеров позволяет ссылаться на существующие базы данных и интегрировать вашу статью с более широкой коллекцией научной информации.

Цифры

Если статья будет принята к публикации, автору будет предложено предоставить готовые к печати версии рисунков в высоком разрешении. При подготовке фигур к производству убедитесь, что файлы соответствуют нашим рекомендациям по подготовке рисунков и таблиц. После принятия авторам также будет предложено предоставить привлекательное изображение, чтобы выделить свою статью в Интернете. Все рисунки будут опубликованы под лицензией Creative Commons с указанием авторства, которая позволяет их свободно использовать, распространять и использовать при условии указания надлежащего указания авторства. Пожалуйста, не отправляйте изображения, на которые ранее распространялись авторские права, если у вас нет явного письменного разрешения от правообладателя на публикацию по лицензии CCAL.

Легенды фигур

Целью легенды к рисунку должно быть описание ключевых идей рисунка, но рисунок также должен обсуждаться в тексте. Увеличенную версию рисунка и его полную легенду часто можно просмотреть в отдельном окне в Интернете, и читатель должен иметь возможность понять рисунок, не переключаясь между этим окном и соответствующими частями текста. Каждая легенда должна иметь краткое название длиной не более 15 слов. Сама легенда должна быть лаконичной, но при этом объяснять все символы и сокращения. Избегайте длинных описаний методов.

Таблицы

Все таблицы должны иметь лаконичный заголовок. Сноски могут использоваться для пояснения сокращений. Цитаты должны быть указаны в том же стиле, который указан выше. По возможности следует избегать таблиц, занимающих более одной печатной страницы. Таблицы большего размера можно публиковать в качестве вспомогательной информации в Интернете. Таблицы должны состоять из ячеек; не используйте элементы изображений, текстовые поля, вкладки или возвраты в таблицах. При подготовке таблиц к производству убедитесь, что файлы соответствуют нашим рекомендациям по подготовке рисунков и таблиц.

1) Когда вы отправляете статью; таблицы и рисунки необходимо предоставить отдельными файлами.

2) Таблицы должны быть в формате Word.doc.

3) Линейные графики должны быть в формате tif или eps и разрешением 900-1200 dpi. Если вы не уверены в этом, пришлите нам график в формате Microsoft Excel, и мы преобразуем его в форматы eps или tif.

4) Фотографии без текста должны быть в формате jpg или tif с разрешением 500+ dpi. Если у вас нет формата tif или eps, отправьте его в формате jpg.

5) Изображения, содержащие комбинацию текстовых и графических элементов, должны быть в формате jpg, tif или eps с разрешением 500-1200 dpi. Если у вас нет формата tif или eps, отправьте его в формате jpg.

**** Как правило, мы НЕ принимаем изображения с разрешением ниже 300 точек на дюйм. Вы должны предоставить как минимум формат jpg, чтобы мы могли соответствующим образом изменить его на любой другой формат.

**** Обратите внимание, что все изображения должны быть большими (больше предполагаемого размера) и с высоким разрешением.

Для получения дополнительной информации о требованиях к качеству изображений посетите: Национальная медицинская библиотека.

Обратите внимание, что мы будем строго соблюдать эти условия, и файлы, не соответствующие этим требованиям, не будут рассматриваться для публикации. Мультимедийные файлы и вспомогательная информация

Мы рекомендуем авторам присылать необходимые вспомогательные файлы и мультимедийные файлы вместе со своими рукописями. Все вспомогательные материалы подлежат экспертному рассмотрению и должны иметь размер менее 10 МБ из-за трудностей, с которыми некоторые пользователи могут столкнуться при загрузке или скачивании файлов большего размера. Если ваш материал весит более 10 МБ.

Вспомогательные файлы должны относиться к одной из следующих категорий: набор данных, рисунок, таблица, текст, протокол, аудио или видео. Вся вспомогательная информация должна упоминаться в рукописи с заглавной буквы S (например, на рисунке S4 указан четвертый рисунок вспомогательной информации). Названия (и, при желании, легенды) всех файлов вспомогательной информации должны быть указаны в рукописи под заголовком «Вспомогательная информация».